脑功能康复与成像研究所成立于2011年，现为四川省卫健委医学乙级重点实验室。

研究所定位于神经-影像-功能调控交叉领域，面向“疑难神经、精神疾病的早期影像诊断、治疗”这一主题，围绕脑疾病发病的影像学机制、脑刺激技术对脑疾病的功能调控、临床神经功能康复及临床转化应用三大方向开展研究。

研究所现有四川省医学甲级重点学科带头人、研究科学家、博士后/博士、硕士研究生等专职研究人员。此外，研究所承担高级技术人才及川北医学院、西南医科大学硕士研究生培养任务，培养技术骨干、硕士研究生等60余人。

研究所现配备有脑刺激磁共振功能成像系统、丹麦进口MagProR30经颅磁刺激治疗仪、美国进口经颅电刺激仪、荷兰进口经颅磁刺激导航定位仪、肌电诱发电位仪等设备。与CT/MRI室合作基本可以实现对神经、精神疾病完整的影像检查、神经调控等的科研和临床转化体系。

研究所主持、承担包括国家自然科学基金面上项目、中央财政“医改试点城市”资助项目、国家科技部重点研发计划项目、国家工业和信息化部项目、四川省科技支撑项目等科研项目30余项。发表专业学术论文50余篇，其中SCI论文20余篇。参编论著1部。获四川省医学科技奖（推广类）一等奖1项，四川省医学科技奖三等奖1项，南充市科技创新二等奖1项。

研究所在国内率先开展了交互式经颅磁刺激功能磁共振成像技术，该技术的开展对实时、直观了解脑部经颅磁刺激对脑卒中后运动功能障碍、抑郁、焦虑、老年痴呆（AD）、失眠、记忆减退等多种神经、精神疾病神经调控机制及治疗效果。

研究所在科研成果转化方面做了大量工作，取得了可喜的成绩。把科研成果上的脑功能神经网络调控机制的研究结果应用于指导治疗上最佳治疗方案、最佳治疗参数的设置，达到个体化、精准化治疗的目的。目前已广泛应用于中风后运动功能障碍的恢复、情绪障碍、认知障碍、睡眠障碍的调节等。